Az optikai mikroszkópok látható fényt használnak a minták megtekintéséhez. A vírusok igen kis mérete miatt általában nagyobb nagyítású mikroszkóp szükséges megfigyelésükhöz. Mivel azonban a vírusok mérete közel van a látható fény hullámhosszához vagy még kisebb is, ez korlátozza a vírusok optikai mikroszkóppal történő közvetlen megfigyelésének felbontását. Ezért a vírusok részletesebb megismeréséhez gyakran elektronmikroszkópra van szükség.
Az elektronmikroszkópok fénynyalábok helyett elektronsugarat használnak, és nagyobb felbontást tudnak elérni, mint az optikai mikroszkópok. Az elektronmikroszkóppal magasabb szintű nagyítást és felbontást biztosíthat a vírus részleteinek, lehetővé téve a tudósok számára a vírusok szerkezetének és tulajdonságainak részletesebb tanulmányozását.
A vírus megtekintéséhez szükséges nagyítás mértéke a vírus méretétől és a szükséges részletességtől függ. Mivel a vírusok mérete gyakran a nanoméretű tartományba esik, megfigyelésükhöz gyakran nagyobb nagyítású mikroszkópokra van szükség.
A fénymikroszkópok általában 1000-2000-szeres nagyítást biztosítanak. Ez a nagyítás elegendő néhány nagyobb vírus, például nagy DNS-vírusok megfigyeléséhez.
Kisebb vírusok esetén vagy ahol nagyobb felbontású részletekre van szükség, elektronmikroszkópot használnak. Az elektronmikroszkópok nagyobb nagyítást biztosítanak, gyakran eléri a 100-szorosát, 000-szeresét vagy még többet is. Ez a nagy nagyítás részletesebb képet ad a vírus szerkezetéről és jellemzőiről.
Fontos megjegyezni, hogy nem a nagyítás az egyetlen tényező, amely befolyásolja a vírusok megfigyelését. A felbontás szintén fontos tényező, amely meghatározza a mikroszkóp által feloldható legkisebb részlet méretét. Kisebb vírusok esetén nagyobb felbontású mikroszkóp szükséges a finomabb részletek rögzítéséhez.