A biológiai mikroszkóp nagyítása jellemzően alacsony, 40x és 1000x között mozog. Ennek az az oka, hogy a biológiai minták általában átlátszóak, és mérsékelt nagyítást igényelnek a sejtek és szövetek szerkezetének megfigyeléséhez.
A biológiai mikroszkópban a nagyítást az objektívlencse és a szemlencse kombinációja határozza meg. Az általános objektív-nagyítások közé tartozik a 4-szeres, 10-szeres, 40-szeres és 100-szoros, míg a szemlencse általában 10-szeres nagyítású. Ezért egy tipikus biológiai mikroszkóp maximális nagyítása 100x objektív szorozva 10x okulárral, ami 1000x.
Fontos megjegyezni, hogy a biológiai mikroszkóp nagyítása nem olyan nagy, mint az elektronmikroszkópé, mivel a biológiai minták gyakran összetett szerkezetűek, és a megfigyelési folyamat megköveteli a minták életképességének és integritásának megőrzését. Ezenkívül a biológiai mikroszkóp felbontása is kulcsfontosságú, mivel a biológiai struktúrák gyakran nagyon kicsik, és nagy felbontást igényelnek a finom részletek megfigyeléséhez.
Bizonyos speciális alkalmazásokban, amelyek nagyobb nagyítást igényelnek, mint például a patológiai kutatás vagy a mikrosebészet, nagyobb nagyítású okulár (pl. 16-szoros vagy nagyobb) használható megfelelő okulárokkal kombinálva a nagyobb nagyítás elérése érdekében. Ezek a nagy nagyítású megfigyelések azonban általában bonyolultabb minta-előkészítést és mikroszkópos technikákat igényelnek, és nagyobb szakértelmet igényelnek a kezelőtől.